Un grupo de científicos de varios centros de investigación y universidades internacionales ha descubierto 44 nuevos virus de los más abundantes en todos los océanos del planeta. El hallazgo, liderado por Manuel Martínez García del grupo de investigación en Ecología Microbiana Molecular de la Universidad de Alicante (UA), se ha logrado gracias a la aplicación de técnicas punteras que mezclan citometría de flujo y técnicas de genómica y biología molecular. Los resultados se publican hoy, 23 de junio, en la revista científica Nature Communications.
La técnica desarrollada por los investigadores ha desvelado algunos de los virus más abundantes a nivel planetario en todos los océanos, sobre todo en su superficie. “Este hallazgo permite descubrir virus patógenos emergentes, imposibles de cultivar en el laboratorio por dificultades técnicas. De este modo, esta técnica nos proporciona la información genómica que lleva cada virus, con lo que se puede saber de qué virus se trata”, explica Martínez García.
Hasta la fecha se tenían pistas, pero se desconocían cuáles eran algunos de los virus más abundantes en los océanos del planeta. Este estudio arroja luz sobre esta cuestión y da paso al estudio de otros ecosistemas. “Con el uso de esta nueva tecnología, abrimos la puerta a descifrar la viriosfera terrestre”, comenta Òscar Fornas, uno de los investigadores implicados y jefe de la Unidad de Citometría de Flujo de la Universidad Pompeu Fabra (UPF) y el Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona. “No sólo sirve para descubrir nuevos virus o ver la ecología de grandes grupos de virus en las muestras estudiadas, sino que también sienta las bases para estudiar los diferentes virus presentes en un ecosistema concreto. En esta dirección, el cuerpo humano es un ecosistema concreto y aquí es donde radica gran parte del futuro de este proyecto o de posible proyectos emergentes.” Ahora, y tras lograr detectarlos en medios acuáticos, los investigadores la están aplicando a muestras humanas, como es la saliva.
Según Martínez García “el logro está en que hemos separado un único virus del conjunto de virus. El proceso pasa por romper la cápside; a continuación se hacen copias del genoma con técnicas de biología molecular. Y después ya podemos secuenciar el ADN y con eso, accedemos a la información genética: ya sabemos ‘quién es el virus’.” “Es la primera vez que se realiza el estudio genómico de partículas víricas individualizadas de manera eficiente”, añade Fornas, cuya unidad ha sido la encargada de separar una a una cada partícula vírica.
El artículo “Single-virus genomics reveals hidden cosmopolitan and abundant viruses” es la conclusión de la investigación liderada por Manuel Martínez García del grupo de investigación en Ecología Microbiana Molecular de la Universidad de Alicante en colaboración con la doctora Josefa Antón Botella, coordinadora del mismo grupo, el grupo de Genómica Evolutiva de la Universidad Miguel Hernández, del doctor Rodríguez Valera; el Instituto de Ciencias del Mar de Barcelona (ICM) del CSIC en Barcelona; con los doctores Josep Maria Gasol y Silvia Acinas; y con el doctor Òscar Fornas, de la Universidad Pompeu Fabra; además de dos grupos americanos de investigación: la Universidad de Ohio y el Centro de Investigación Marino Bigelow Laboratory for Ocean Sciences.
Referencia: Martinez-Hernandez F, Fornas O, Lluesma M, Bolduc B, Cruz MJ, Martínez Martínez J, Antón J, Gasol J, Rosselli R, Rodríguez-Valera R, Sullivan MB, Acinas S and Manuel Martinez-Garcia. Single-virus genomics reveals hidden cosmopolitan and abundant viruses Nature Communications, Junio 2017 DOI: 10.1038/NCOMMS15892
